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[光明日报]首个桃基因完整变异组图谱构建

发布时间:2025-05-07 |来源: 光明日报|作者:杨舒
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【瞧!我们的前沿科技】 

近日,中国农业科学院郑州果树研究所资源与育种创新团队构建了首个桃的基因完整变异组图谱,新发现70.6%的变异和3289个基因,揭示了全球桃的亲缘关系和进化路线,显著提高木本果树基因发掘的效率,为桃的分子育种提供理论依据和基因资源。相关成果发表在植物科学领域重要期刊《分子植物》上。

桃是多年生落叶果树,在我国已经有4000多年的栽培历史。研究团队负责人介绍,本次研究利用的桃基因组重测序数据,来自1020份桃种质资源。研究团队分别检测了目前已知的所有桃基因变异类型,系统梳理发现所有桃的基因变异,其中,70.6%的变异为本次新发现,最终构建了首个桃的基因完整变异组图谱。同时,研究团队构建了1020份桃种质资源的泛基因组图谱,发现了3289个新基因。

通过这些图谱,研究人员发现,桃在驯化和进化过程中,基因数目显著增加,这表明栽培桃与野生桃有持续的基因交流。但是,全球桃的栽培品种间有大量共享的基因组片段,桃野生种和栽培种间共享的基因组片段却较少——这表明,栽培桃的遗传背景相对狭窄且抗性基因匮乏。基于完整的变异组图谱,桃的进化历史也被清晰地勾勒出来。研究人员发现,扁桃参与山桃的形成,栽培桃最可能的直接野生祖先是光核桃,甘肃桃也参与了新疆桃的形成。

利用大量的基因组数据,本次研究还发现,绝大多数桃的遗传性状并非由单一基因变异决定,由此,研究人员提出基于完整变异组的基因定位新策略。通过应用这一策略,新发现超过2000个桃性状的关联基因变异,实现更多性状的关键关联基因和功能变异的“一步”鉴定。

(单位: 中国农业科学院郑州果树研究所)
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